大旺园区于2001年底经省政府批准设立，面积25平方公里，位于肇庆市大旺综合经济开发区内。肇庆市大旺综合经济开发区总面积98平方公里，前身为广东省大旺华侨农场，广东省大旺农场于1958年成立，建场初期，农场就从广州、汕头招收工人和经组织安排中，安置有从马来西亚、印尼、泰国、越南等国50多名归侨在农场各条战线工作。

　　1978年6月至1979年9月，农场安置旅越难侨共6376人，广东省大旺农场也改称为广东省大旺华侨农场。建场以来，隶属关系几经更替，曾经三水、四会、肇庆市农委、省农垦厅主管，1988年下放肇庆市管理，1992年设立大旺综合经济开发区，赋予县一级行政和经济管理职能。

　　2001年底，肇庆高新技术产业开发区扩园迁址至大旺，与大旺综合经济开发区合署，实行“一区两园”的发展模式，肇庆高新区管委会作为肇庆市政府的派出机构，受市政府委托开发管理大旺华侨农场的土地以及农业、林业、水利、畜牧、水产等管理工作。

　　肇庆高新技术产业开发区是1998年经省政府批准设立的省级高新区，享有地市一级的经济管理和行政审批权。

　　2001年底经省政府批准扩园迁址到大旺区，所在地总面积98平方公里，首期规划建设面积25平方公里。

　　2004年7月，省政府决定把肇庆高新区建设成为广东省吸收外资重点工业园区和广东省山区吸收外资示范区，并成立了以汤炳权常务副省长为组长、省直22个部门负责人为成员的广东省肇庆高新区规划建设协调领导小组，出台了六项扶持政策大力支持肇庆高新区加快发展。

　　2017年12月26日，被国家知识产权局确定为国家知识产权示范园区，示范工作周期为2018年1月至2020年12月。