肇庆市高等院校有肇庆学院、广东金融学院肇庆校区、广东理工学院、广东工商职业技术大学、肇庆医学高等专科学校、广东信息工程职业学院、广东肇庆航空职业学院等。
截至2019年,肇庆各级各类教育(不含非学历培训,不含技工学校)招生数29.597万人,比上年增7.4%;在校生97.52万人,比上年增长4.4%;毕业生24.76万人,比上年增加1.9%。其中,特殊教育学校招生570人,在校生3100人;学前教育在园幼儿15.64万人。
2020年4月22日,广东省肇庆市与香港都会大学(时名“香港公开大学”)在肇港两地远程签署香港都会大学(肇庆)合作办学协议。